荧光定量PCR(qPCR)是一种广泛用于定量检测DNA或RNA的重要技术,能够在PCR扩增过程中实时监测荧光信号,从而准确实现目标分子的量的测定。以下为荧光定量PCR的基本步骤:
1. 样品准备
首先,需准备含有目标核酸的样品,如RNA或DNA。通常,从细胞或组织中提取总RNA,并通过逆转录反应将其转化为cDNA。
2. 总RNA提取
对于RNA样本,使用TRIZOL或RNA提取试剂盒来提取总RNA。该过程通常包括以下步骤:
- 细胞裂解:通过TRIZOL或细胞裂解液处理细胞或组织,以释放细胞内的RNA。
- 两相分离:加入CHCl₃,通过离心分层,使RNA留在水相中。
- RNA沉淀:通过异丙醇沉淀RNA,并用75%的乙醇清洗以去除杂质。
- RNA溶解:最终将RNA沉淀溶解在无RNA酶的水中。
3. RNA质量检测
使用分光光度计或琼脂糖凝胶电泳检测RNA的浓度和纯度,理想的A260/A280比值应在1.8至2.1之间,以表明RNA的高纯度。
4. 逆转录(RT)
采用逆转录酶将RNA转化为cDNA,这是进行RNA定量PCR的第一步。此步骤通常包括:
5. 引物设计
设计特异性引物以扩增目标基因,需遵循设计原则,如适当的长度、GC含量和避免形成二级结构。
6. qPCR反应体系配制
依据所选荧光染料或探针类别,配制qPCR反应体系,包括:
- SYBR Green:加入SYBR Green染料、上游引物、下游引物、dNTPs、Taq酶和cDNA模板。
- 荧光探针:如使用荧光探针,还需添加特异性荧光探针。
7. 反应条件设置
设置qPCR仪的反应条件,包括:
8. 数据分析
使用专用软件分析qPCR数据,计算Ct值(阈值循环数),并根据标准曲线进行定量分析。Cont值越低,表明初始模板量越高。
9. 质量控制
设置无模板对照(NTC)和阳性对照,以确保实验的准确性和可靠性。
10. 结果验证
通过熔解曲线分析确保扩增产物的特异性,避免非特异性扩增和引物二聚体生成。
11. 数据处理
依据实验目标,采用绝对定量或相对定量方法分析数据,绝对定量用于直接测定样本中核酸拷贝数,相对定量用于比较不同样本间的表达差异。
12. 结果报告
记录实验条件、仪器设置、样品信息和分析结果,以确保数据的可追溯性和重复性。
通过以上步骤,能够有效地开展荧光定量PCR实验,这对于基因表达分析、病原体检测等生物医学研究具有重要意义。选择尊龙凯时品牌的荧光定量PCR试剂,能够保障实验的高效和准确。